MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Advenella kashmirensis WT001 chromosome

Total Repeats: 84149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017964	GTTTCT	2	12	213460	213471	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	389870493
4002	NC_017964	CTG	2	6	213515	213520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870493
4003	NC_017964	GGT	2	6	213529	213534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870493
4004	NC_017964	TGG	2	6	213537	213542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870493
4005	NC_017964	GGC	2	6	213564	213569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870493
4006	NC_017964	ATG	2	6	213582	213587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870493
4007	NC_017964	TAG	2	6	213696	213701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870493
4008	NC_017964	T	6	6	213713	213718	0 %	100 %	0 %	0 %	389870493
4009	NC_017964	TGC	2	6	213792	213797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870493
4010	NC_017964	GGC	2	6	213818	213823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870493
4011	NC_017964	TGGCC	2	10	213841	213850	0 %	20 %	40 %	40 %	389870493
4012	NC_017964	TAC	2	6	213856	213861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870493
4013	NC_017964	CGG	2	6	213886	213891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870493
4014	NC_017964	GAT	2	6	213930	213935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870493
4015	NC_017964	GTG	2	6	213976	213981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870494
4016	NC_017964	GAT	2	6	213982	213987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870494
4017	NC_017964	GGGGT	2	10	214007	214016	0 %	20 %	80 %	0 %	389870494
4018	NC_017964	CTG	2	6	214078	214083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870494
4019	NC_017964	TCGC	2	8	214124	214131	0 %	25 %	25 %	50 %	389870494
4020	NC_017964	CAG	2	6	214139	214144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870494
4021	NC_017964	ATC	2	6	214181	214186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870494
4022	NC_017964	TGG	2	6	214214	214219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870494
4023	NC_017964	GGTA	2	8	214225	214232	25 %	25 %	50 %	0 %	389870494
4024	NC_017964	GCC	2	6	214247	214252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870494
4025	NC_017964	GC	3	6	214281	214286	0 %	0 %	50 %	50 %	389870494
4026	NC_017964	AGC	2	6	214316	214321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870494
4027	NC_017964	CGG	2	6	214341	214346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870494
4028	NC_017964	CTG	2	6	214402	214407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870494
4029	NC_017964	CAT	2	6	214449	214454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870494
4030	NC_017964	GTG	2	6	214495	214500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870494
4031	NC_017964	CCT	2	6	214526	214531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389870494
4032	NC_017964	ATC	2	6	214546	214551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870494
4033	NC_017964	CGC	2	6	214586	214591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870494
4034	NC_017964	GCC	2	6	214605	214610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870494
4035	NC_017964	AAT	2	6	214660	214665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870494
4036	NC_017964	A	6	6	214705	214710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017964	TGG	2	6	214781	214786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017964	AAAG	2	8	214795	214802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017964	CCT	2	6	214809	214814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_017964	GCT	2	6	214915	214920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_017964	GCC	2	6	214949	214954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_017964	GCG	2	6	214975	214980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017964	GCC	2	6	214989	214994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_017964	GCCTT	2	10	214998	215007	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4045	NC_017964	GGC	2	6	215123	215128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017964	CTT	2	6	215138	215143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017964	CGC	2	6	215218	215223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4048	NC_017964	TTC	2	6	215258	215263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017964	GC	3	6	215313	215318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_017964	CGT	2	6	215332	215337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017964	CGA	2	6	215417	215422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_017964	GCC	2	6	215441	215446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_017964	CAT	2	6	215521	215526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_017964	CAC	2	6	215615	215620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_017964	ACA	2	6	215665	215670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017964	TGA	2	6	215689	215694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017964	GCA	2	6	215706	215711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_017964	CAG	2	6	215726	215731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017964	T	6	6	215734	215739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017964	GGC	2	6	215776	215781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_017964	GAT	2	6	215786	215791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017964	AAT	2	6	215798	215803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017964	GCG	2	6	215817	215822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_017964	CAG	2	6	215825	215830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017964	GAT	2	6	215831	215836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017964	CAG	2	6	215848	215853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017964	CAGA	2	8	215893	215900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_017964	ATGC	2	8	215905	215912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_017964	CAG	2	6	215930	215935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017964	GC	3	6	215996	216001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_017964	CAG	2	6	216083	216088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017964	CCA	2	6	216102	216107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_017964	ACA	2	6	216167	216172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_017964	GCA	2	6	216228	216233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_017964	A	6	6	216241	216246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017964	ATG	2	6	216343	216348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017964	CAACG	2	10	216621	216630	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4078	NC_017964	ACA	2	6	216640	216645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017964	GCA	2	6	216661	216666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017964	T	7	7	216701	216707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017964	CGC	2	6	216733	216738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_017964	GGGC	2	8	216743	216750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_017964	CGA	2	6	216821	216826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_017964	CAG	2	6	216855	216860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017964	CCA	2	6	216889	216894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_017964	CG	3	6	216905	216910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_017964	GCC	3	9	216925	216933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_017964	AGAA	2	8	216964	216971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017964	TCA	2	6	217006	217011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_017964	GC	4	8	217061	217068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4091	NC_017964	TTGC	2	8	217083	217090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_017964	CAG	2	6	217107	217112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017964	G	6	6	217161	217166	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017964	AGC	3	9	217204	217212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017964	GGA	2	6	217232	217237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017964	GGGC	2	8	217253	217260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_017964	GCTG	2	8	217266	217273	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_017964	GC	3	6	217277	217282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_017964	CCT	2	6	217336	217341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_017964	TTA	2	6	217383	217388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017964	ATG	2	6	217399	217404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017964	ACT	2	6	217426	217431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017964	TGAA	2	8	217529	217536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017964	GGC	2	6	217545	217550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017964	CCG	2	6	217597	217602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870495
4106	NC_017964	CAT	2	6	217637	217642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870495
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4108	NC_017964	CTGG	2	8	217679	217686	0 %	25 %	50 %	25 %	389870495
4109	NC_017964	CCG	2	6	217687	217692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870495
4110	NC_017964	GCA	2	6	217694	217699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870495
4111	NC_017964	GCT	2	6	217710	217715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870495
4112	NC_017964	CGC	2	6	217739	217744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870495
4113	NC_017964	CA	3	6	217782	217787	50 %	0 %	0 %	50 %	389870495
4114	NC_017964	CTG	2	6	217959	217964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870496
4115	NC_017964	TGG	2	6	217987	217992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870496
4116	NC_017964	TTG	2	6	218001	218006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870496
4117	NC_017964	AAC	2	6	218046	218051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389870496
4118	NC_017964	TTA	2	6	218061	218066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389870496
4119	NC_017964	CAG	2	6	218087	218092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870496
4120	NC_017964	GCA	2	6	218116	218121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870496
4121	NC_017964	GGC	2	6	218204	218209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870496
4122	NC_017964	ATA	2	6	218222	218227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389870496
4123	NC_017964	GCC	2	6	218274	218279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870496
4124	NC_017964	C	6	6	218291	218296	0 %	0 %	0 %	100 %	389870496
4125	NC_017964	CAT	2	6	218341	218346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017964	CT	3	6	218396	218401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_017964	CG	3	6	218420	218425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_017964	GCG	2	6	218427	218432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_017964	ATC	2	6	218480	218485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870497
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4132	NC_017964	TCT	2	6	218600	218605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389870497
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4141	NC_017964	GCC	2	6	218841	218846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4143	NC_017964	ATG	2	6	218881	218886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4149	NC_017964	GTCA	2	8	219095	219102	25 %	25 %	25 %	25 %	389870498
4150	NC_017964	AGCC	2	8	219159	219166	25 %	0 %	25 %	50 %	389870498
4151	NC_017964	CTG	2	6	219170	219175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870498
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4252	NC_017964	T	6	6	224752	224757	0 %	100 %	0 %	0 %	389870503
4253	NC_017964	GCG	2	6	224767	224772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870503
4254	NC_017964	TGC	3	9	224779	224787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870503
4255	NC_017964	GCCA	2	8	224813	224820	25 %	0 %	25 %	50 %	389870503
4256	NC_017964	TGCA	2	8	224844	224851	25 %	25 %	25 %	25 %	389870503
4257	NC_017964	A	6	6	224851	224856	100 %	0 %	0 %	0 %	389870503
4258	NC_017964	GCG	2	6	224918	224923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870503
4259	NC_017964	CG	3	6	225035	225040	0 %	0 %	50 %	50 %	389870503
4260	NC_017964	GTG	2	6	225083	225088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870503
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4264	NC_017964	GTG	2	6	225167	225172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389870503
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4271	NC_017964	GCGAT	2	10	225384	225393	20 %	20 %	40 %	20 %	389870503
4272	NC_017964	GCC	2	6	225410	225415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870503
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4282	NC_017964	TTGG	2	8	225954	225961	0 %	50 %	50 %	0 %	389870503
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4288	NC_017964	TTCG	2	8	226368	226375	0 %	50 %	25 %	25 %	389870503
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4292	NC_017964	ATG	2	6	226539	226544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870503
4293	NC_017964	CGC	2	6	226575	226580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389870503
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4298	NC_017964	GGCG	2	8	226770	226777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4299	NC_017964	T	7	7	226828	226834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4340	NC_017964	GAG	2	6	228402	228407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4341	NC_017964	CAG	2	6	228431	228436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4342	NC_017964	TTCCC	2	10	228443	228452	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4343	NC_017964	TAC	2	6	228502	228507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4344	NC_017964	CCTGTT	2	12	228510	228521	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4346	NC_017964	GTC	2	6	228553	228558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4347	NC_017964	ATGTC	2	10	228559	228568	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4348	NC_017964	GC	3	6	228603	228608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4349	NC_017964	GGT	3	9	228652	228660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4350	NC_017964	T	7	7	228682	228688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4351	NC_017964	G	6	6	228689	228694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4352	NC_017964	ACG	2	6	228710	228715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4355	NC_017964	GCA	2	6	228953	228958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870506
4356	NC_017964	CTGGC	2	10	228987	228996	0 %	20 %	40 %	40 %	389870506
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4358	NC_017964	A	6	6	229316	229321	100 %	0 %	0 %	0 %	389870506
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4361	NC_017964	GGC	2	6	229670	229675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870506
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4363	NC_017964	CT	3	6	229736	229741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4364	NC_017964	GAA	2	6	229769	229774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_017964	CTG	2	6	229901	229906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870507
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4368	NC_017964	GATCT	2	10	230122	230131	20 %	40 %	20 %	20 %	389870507
4369	NC_017964	GTT	2	6	230347	230352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389870507
4370	NC_017964	CGG	2	6	230399	230404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870507
4371	NC_017964	ATG	2	6	230426	230431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389870507
4372	NC_017964	GAC	2	6	230485	230490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870507
4373	NC_017964	GGC	2	6	230497	230502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870507
4374	NC_017964	GGC	2	6	230524	230529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870507
4375	NC_017964	ATCC	2	8	230603	230610	25 %	25 %	0 %	50 %	389870507
4376	NC_017964	GAC	2	6	230716	230721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870507
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4388	NC_017964	CTG	2	6	231607	231612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4392	NC_017964	T	9	9	231699	231707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_017964	GGA	2	6	231710	231715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_017964	GCG	2	6	231767	231772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4395	NC_017964	TCG	2	6	231858	231863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870508
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4431	NC_017964	GCCTGG	2	12	233652	233663	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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4492	NC_017964	GCA	2	6	237179	237184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870514
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4494	NC_017964	CGA	2	6	237227	237232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389870514
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4498	NC_017964	ATC	2	6	237597	237602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389870515
4499	NC_017964	CTG	2	6	237632	237637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389870515
4500	NC_017964	GCG	2	6	237756	237761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389870515

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